أقام المهندس حمدى الفخراني العضو بمجلس الشعب المنحل دعوى قضائية أمام القضاء الإداري برقم 54850 لسنة 66 قضائية طالب فيها الرئيس محمد مرسي والمشير محمد حسين طنطاوي وزير الدفاع والفريق سامي عنان رئيس الأركان بتدمير الأنفاق بين رفح المصرية ورفح الفلسطينية تدميرا كاملا لإضرارها بالأمن القومي حيث تستخدم فى تهريب السلع والمواد البترولية كما استخدمت في تسلل العناصر الجهادية التى قتلت شهداء القوات المسلحة. وطالب الفخرانى فى الدعوى بالغاء قرار الرئيس محمد مرسي الخاص بدخول المواطنين الفلسطينيين إلى سيناء بدون تأشيرة مسبقة حيث أن هذا القرار يسمح للعناصر المندسة والإرهابية بالتسلل لسيناء دون عبء. وحمل الفخراني فى دعواه الرئيس مرسي مسئولية مقتل شهداء الجيش ال16 وذلك بسبب إفراجه عن القيادات الجهادية قبل الحادث بأربعة أيام مما كان له بالغ الضرر على الأمن القومى المصرى.