قال الدكتور هشام الأزهري وكيل كلية الدراسات الإسلامية والعربية جامعة الأزهر بدمياط، إن أبا حيان التوحيدي مر بظروف صعبة جدا، فقد كانت الدولة البويهية هي المسيطرة على الخلافة الإسلامية، وحاول كثيرا أن يتصل بالأمراء والوزراء، لكنهم صدوه، وكانوا يطلبونه للعقاب لسوء ظنهم فيه. وأضاف الأزهري خلال حواره مع الإعلامية قصواء الخلالي مقدمة برنامج «في المساء مع قصواء»، على قناة cbc: «البعض اتهمه بالزندقة والإلحاد وبخاصة الإمام الذهبي في سير أعلام النبلاء، لكن أنصفه كثير من العلماء والمؤرخين منهم ابن النجار وهو المؤرخ العراقي وكذلك تاج الدين السبكي». وتابع وكيل كلية الدراسات الإسلامية والعربية جامعة الأزهر بدمياط أن أكثر من نقل ترجمته هو ياقوت الحموي في معجم الأدبي، ونصفه كثيرا وأطال التعريف به في هذا الكتاب حتى عابه البعض، مشددًا على أن من وصفوه بالزندقة لم يأتوا بدليل قاطع على اتهامهم، أما تاج الدين السبكي فقال إنه وقف على كتبه ولم يرَ فيها ما يدعو إلى الاتهام بالزندقة.