استمراراً لحالة الجدل القائمة داخل الكنيسة لعدم الاعلان رسمياً عن قرار البابا شنودة باختيار الأنبا بطرس الأسقف العام سكرتيراً خاصاً تحفظ عدد من الأساقفة من عدم توزيع - القرار البابوي عليهم حتي الآن وضرورة تحديد مهام السكرتير الجديد لرأب الصداع الداخلي حول صراعات الأساقفة الكبار. وأشار القمص عبدالمسيح بسيط استاذ اللاهوت الدفاعي وتاريخ العقيدة الي ان اختيار سكرتير ثالث يأتي بسبب المهام الكثيرة المخولة لهذا الموقع كمتابعة الكنائس الأخري ومشاكل الشعب القبطي والعلاقة مع الدولة. وأرجع اختيار الأنبا بطرس لكونه الأكثر تفرغا في ظل المسئولية الكبيرة التي تقع علي الأساقفة المسئولين عن ابراشيات مستبعداً أن يتسبب قرار البابا في أي حساسيات بين سكرتارية البابا. فيما نفقت الكنيسة القبطية ما تردد حول عزل الانبا يؤانس السكرتير الخاص للبابا من منصبه. في الوقت الذي انتشرت فيه الشائعات بين الاساقفة والاقباط بعزله علي غرار شائعة وفاة البابا، حيث توافد عدد من انصار الانبا يؤانس لمعرفة صحة استبعاده من عدمه. وقال الانبا مرقس رئيس لجنة الاعلام بالكنيسة ان الانبا يؤانس لا يزال سكرتيرا للبابا مشيرا الي انه اجري اتصالات به لمناقشة الاوضاع الاخيرة التي شهدتها الكنيسة عقب اعلان الانبا بطرس بتعيينه سكرتيراً للبابا.