لم تتوقف الشائعات التي نحيط بباسم يوسف وبرنامجه "البرنامج" حتى بعد إنطلاق البرنامج، حيث زعمت بعض المواقع والجروبات على موقع التواصل الاجتماعي فيس بوك صباح اليوم أن بعض محبي الفريق أول عبدالفتاح السيسي اقتحموا مسرح راديو الذي يتم فيه تصوير الحلقات وهدموا الديكور وألقوا به خارج المسرح اعتراضا على سخرية باسم يوسف من شعبية السيسي في الحلقة الأولى من الموسم الثالث ب "البرنامج". عيون ع الفن تأكدت من مصادرها الخاصة بأنه لا صحة إطلاقا لتلك الشائعات وأنها تعد نوعا من الحرب النفسية والشائعات التي تحاول النيل من مقدم البرنامج وفريق العمل حتى يؤثروا على المضمون الجريء الذي يقدمه. وقد أثارت الحلقة الأولى من الموسم الثالث للبرنامج والتي أذيعت أول أمس الجمعة العديد من ردود الفعل المختلفة، حيث قال البعض أن باسم يوسف قدم حلقة متوازنة وجريئة فيما اتهمه أخرون بمحاولته السخرية من قادة ورموز الدولة وهو ما يهدد الأمن القومي، فيما اعترض البعض على الإيحاءات الجنسية التي تضمنتها الحلقة.