فشلت جماعة الإخوان فيما خططته لشل حركة مترو الأنفاق باعتباره مرفقًا خدميًّا حيويًّا عبر محاولة تجميع الآلاف من أنصارها لركوب عربات المترو وعدم النزول منها لمدة 3 ساعات، تمهيدًا لحالة عصيان مدني دعت إليها الجماعة اليوم الأحد. ورغم هذا الفشل، شهدت مناطق وسط المدينة شللًا مروريًّا، حيث فضل الكثيرون اللجوء لوسائل مواصلات أخرى خشية الشل الذي كان محتملًا في المترو. وقامت وزارة الداخلية بوضع خطة شاملة وكاملة لتأمين مترو الأنفاق لتفادي أي محاولات لتعطيل المترو من قبل أنصار الرئيس المعزول محمد مرسي، وأصدرت وزارة الداخلية بيانًا أكدت فيه أنها لن تسمح بأي محاولات لتخريب المنشآت العامة وأنها ستتصدى بكل حزم وقوة لأي محاولات لتعطيل المترو الذي بدأت عرباته في الانتظام منذ الساعة السادسة من صباح اليوم، وتم نشر فرق الطوارئ في كل المحطات بالتعاون مع شرطة النقل والمواصلات التي شكلت لجانًا في كل المحطات لضمان عدم تعطيل المترو. ويعد مترو الأنفاق أكثر وسائل المواصلات حيوية، حيث ينقل ما يقرب من 3.6 مليون راكب يوميًّا، ويعمل جميع أيام الأسبوع مراعيًا التوقيتات المعلن عنها بالنسبة لحظر التجوال كما يتم العمل فيه لفترات إضافية في المناسبات الخاصة والأعياد. ومترو أنفاق القاهرة يعد أحد أهم وسائل المواصلات في العاصمة، وهو أول خط مترو يتم تسييره في مصر والوطن العربي وقارة إفريقيا ويبلغ سعر تذكرة استعماله جنيه مصري واحد لكافة المحطات الرسمية وتخصص عربتا منتصف المترو للسيدات اللائي يسمح لهن باستخدام كافة العربات بالإضافة للعربتين. وتم تشغيل المرحلة الأولى من مترو الأنفاق عام 1983 حيث تم تصميمه لكي ينقل 60 ألف راكب كل ساعة بزمن تقاطر 5. 2 دقيقة وسرعة قصوى 100 كيلومتر في الساعة، وتقع معظم محطات الخط الأول فوق سطح الأرض ويشغل النفق 5 محطات فقط هي الواقعة في وسط القاهرة وهي الشهداء "رمسيس"، أحمد عرابي، جمال عبد الناصر، أنور السادات، وسعد زغلول. ويمتد الخط الثاني من محطة شبرا الخيمة بمحافظة القليوبية إلى محطة المنيب بمحافظة الجيزة بطول 19 كيلومترًا "20 محطة". ويتم الآن استكمال الخط الثالث من المترو والذي سيمتد من مدينة العبور مرورًا بمدينة السلام "الحرفيين"، لمطار القاهرة الدولي حيث ينقسم الى جزأين يصل أحدهما إلى إمبابة ثم بشتيل فيما يصل الثاني إلى بولاق ويمتد ليتقاطع مع الخط الثاني في محطة جامعة القاهرة ويبلغ طول الخط الثالث 30 كيلومترًا، أما الخط الرابع للمترو فقد وافقت وزارة الدولة لشؤون البيئة على إقامته بعد استيفاء جميع الاشتراطات البيئية اللازمة للحفاظ على البيئة، وسيبدأ هذا الخط من حي الهرم ليمتد إلى مدخل مدينة 6 أكتوبر عند تقاطع الطريق الدائري مع طريق الواحات ويبلغ طول المرحلة الأولى منه 17.2 كيلومترًا وعدد محطاته 15 محطة.