رصدت "التنسيقية المصرية للحقوق والحريات"ارتكاب مليشيات أمن الانقلاب 69 جريمة وانتهاكًا لحقوق الإنسان بحق المصريين خلال الفترة من 30 يونيو وحتى 6 يوليو 2018، تنوعت ما بين اعتقال وإخفاء قسري. واحتلت محافظة الشرقية المرتبة الأولى من حيث الانتهاكات بعدد (29) حالة، تلتها بقية المحافظات، ومشلت تلك الجرائم اعتقال 6 من مواطنين بينهم 4 أطباء بالغربية، واعتقال 2 من المواطنين بكفر الشيخ، واعتقال 12 من مواطنًا بينهم محام وشقيقان بالشرقية، واعتقال طبيب و2 آخرين بالمنوفية، فضلا عن اعتقال السيدة "ميرڤت الحسيني" بالجيزة. وشملت جرائم الانقلابيين أيضا إخفاء 9 مواطنين قسريا بالإسكندرية، واستمرار الإخفاء القسري لمعلم منذ 5 أيام بالشرقية، واستمرار الإخفاء القسري ل"محمد أبوالناس" بالقاهرة، وإخفاء مواطن قسريا وحبس وزوجته 15 يوما، واستمرار الإخفاء القسري لطالب جامعي بالشرقية، واستمرار الإخفاء القسري للمواطن "وليد الدوغري" منذ 5 شهور، فضلا عن استمرار الإخفاء القسري للمواطن "مدحت البيك" رغم قرار إخلاء سبيله بعد 4 أعوام من الاعتقال.