أكد الأنبا باخوميوس قائم مقام البابا أن الأقباط لا يخشون وصول جماعة الإخوان المسلمين للحكم، موضحا أن التعامل يتم مع الحاكم بالقانون وليس بانتمائه. وأوضح باخوميوس في حوار مع برنامج "آخر النهار" :" حتى الآن نرضي بكل ما أصيغ حول حقوق الأقباط في الدستور الجديد" ، مشيرا إلى أن الكنيسة شكلت لجنة لها رؤية في هذا الشأن وقدمت اقتراحات وننتظر الصياغة النهائية للدستور. وتابع قائلا : " طالبنا أن تظل كلمة مبادئ الشريعة بدلا من أحكام ، وان يكون لنا الحق في إقامة تقاليدنا وانتخاب رؤسائنا ". وحول رفض الكنيسة لمراقبة أموالها قال باخوميوس : " لا يجوز الإعلان عن تفاصيل الأموال التي تدخل الكنيسة منعا لإحراج المستفيدين منها" ، مشددا على أن هذه الأموال يجب أن تتم في خفية لأنها بيننا وبين الرب وهناك عنصر ثقة بين العاطي والأخذ والموزع. ورأي باخوميوس أن الأقباط لم يأخذوا حقوقهم كاملة ، مشيرا إلى أن " هناك بعض المناصب في الدولة لا يصل إليها الأقباط". وتابع قائلا:" البعض يسئ للأقباط ويجب مراجعة الخطاب الديني في المساجد بالإضافة إلى أن هناك بعض الإعلاميين أساءوا إلى المسيحيين". وأوضح باخوميوس: " انه سيتم غدا الإعلان عن الاسم الجديد للبابا الذي سيتم اختياره"، لافتا إلى أن القضية الملحة التي تنتظره هي بناء الكنائس، مشددا على أهمية أن يلعب البابا الجديد دورا سياسيا لخدمة القضايا القبطية.
