وجه البابا شنودة الثالث بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية تحذيرات مشددة للاساقفة والكهنة بعدم التلاعب بالأمور الكنسية والعقائدية الثابتة قائلا لهم: مفيش حد فيكم يعطي تعليما من فكره الخاص ونشره بين الناس. وأضاف البابا خلال عظته الاسبوعية بالكاتدرائية المرقسية بالعباسية أمس الأول ان ما يتعب الكنيسة في ظروفنا الحالية أنه يوجد كهنة يعلمون أفكارهم الخاصة وليس العقيدة الثابتة، الأمر الذي يحدث بلبلة وانشقاقاً في الفكر. وانتقد البابا شنودة بعض التصرفات التي يلجأ لها بعض الناس خلال الصلاة حيث يوجد التصفيق والزغاريد وقال رداً علي سؤال من أحد الاقباط حول لجوء مجموعة الخمسينيين التابعة لطائفة البروتستانت الي مثل هذه التصرفات إن طريقة الخمسينيين الذين يسمون أنفسهم البروتستانت الخمسينيين خلال صلواتهم غير صحيحة مؤكدا أن الصلاة لابد أن تكون في خشوع. وعلمت روزاليوسف من الانبا يؤانس سكرتير البابا أنه من المتوقع أن يزور وفد من الطائفة البروتستانتية البابا شنودة الاسبوع المقبل وان كان الأقرب يوم الاحد لمناقشة اسباب هجوم بعض قيادات الكنيسة علي البروتستانت وفي مقدمتهم الانبا بيشوي سكرتير المجمع المقدس.