احاطت فيلم "الاكاديمية" العديد من المشاكل والشائعات التي ارتبطت به منذ بداية تصويره وحتي بعد عرضه في دورالعرض وزادت الشائعات بشكل كبير في هذه الفترة وخاصة بعد ان انتشرت مؤخرا تصريحات غير صحيحة من ابطال الفيلم مما اثار حفيظتهم وقرروا الخروج عن صمتهم والرد علي هذه الشائعات وكان اولهم مخرج الفيلم اسماعيل فاروق والذي عبر عن سعادته بنجاح فيلميه في موسم عيد الفطر وحققاً نجاحاً كبيراً وعن ترشيحه للعمل يقول : فوجئت باتصال تليفوني من السيناريست احمد البيه حيث قال لي انهم كانوا في المونتاج وان الفيلم به العديد من المشاكل في المونتاج وذلك بعد ان اتصلوا بعدد من الزملاء ومنهم المخرج شريف عابدين الا انه اعتذر بسبب ارتباطه بالعديد من الاعمال الا انهم وجدوا انني افضل شخص يقوم بضبط الفيلم وبالفعل وافقت ووجدت ان الفيلم بالتكنيك السينمائي به العديد من المشاكل والاخطاء وقت التصوير بالاضافة الي مشاكل في الاداء التمثيلي بسبب عدم وجود توجيه من المخرج حيث قاموا بالعمل بشكل اجتهادي من النجوم " . واكد فاروق " الفيلم يحتوي علي 120 مشهد كان المخرج محمد انيس قد صور منهم 63 مشهد خلال 4 اسابيع فدخلنا المونتاج وقمنا بعمل "فلترة" لما تم تصويره واضطرنا ذلك لحذف 40 مشهد لم تكن صالحة اما المشاهد ال 20 المتبقية فلم تكن قوية وبعدها قمت بعقد جلسات عمل مع السيناريست احمد البيه لضبط السيناريو من خلال وجهه نظري وبالفعل انتهينا منه باعجوبة " . واكمل اسماعيل فاروق " وخلال اسبوعين انتهينا من التصوير حيث صورنا 80 مشهد منهم مشاكل ثقيلة منها الاكشن و الاثارة و الاغاني و الحفل الموجود في بداية الفيلم واصبح فيلما مرة اخري " . وعلي الجانب الاخر نفي المطرب احمد الشامي بأنه اتهم المؤلف احمد البيه باقتباس فكرة فيلم الأكاديمية من الفيلم الذي كتبه البيه وحمل عنوان " أزاي تخلي البنات تحبك " لهاني سلامة وسمية الخشاب ونور اللبنانية وهند صبري واحمد عيد , لكنه تردد إلي مسامعه هذا الكلام ولم يستطيع إلقاء هذا الاتهام بسبب انه وافق دون ضغط من أحد علي المشاركة في الفيلم .