اشار التحالف المصري لمراقبة الانتحابات أن عملية التصويت استمرت في المرحلة الثانية من الاستفتاء على الدستور الجديد وسط نفس الانتهاكات والتجاوزات التي تم رصدها سواء في المرحلة الأولي، أو خلال الساعات المبكرة من اليوم الثاني للاستفتاء، مثل تأخر فتح باب اللجان وحدوث أعمال عنف واشتباكات، وكذلك بعض الدعاية الانتخابية من أجل التصويت لصالح " نعم" على الدستور ،إلا أن الملمح الذي برز بقوة مع منتصف اليوم هو حدوث عمليات واسعة النطاق لتوجيه الناخبين من أجل التصويت لصالح " نعم" في الاستفتاء على الدستور مستغلين في ذلك الشعارات الدينية من قبيل نصرة الشريعة، وهو الأمر الذي أثار حفيظة بعض القوي المعارضة للدستور ورفضوا مثل هذه الممارسات وإقحام الدين في المعادلة السياسية، وتقسيم المجتمع بين شقي رحى مما ينذر بخطر جسيم على المجتمع المصري ويهدد أمن واستقرار هذا البلد ويعصفه بشكل كبير. كما رصد مراقبون التحالف في التقرير الثاني أن العديد من الانتهاكات التي شابت عملية الاستفتاء من تاخر فتح اللجان تي الساعة 12 ظهرا،كما تم رصد وجود دعاية انتخابية في محافظه الفيوم بمدرسة الراضي الابتدائية بمركز سنورس قيام أشخاص منتمين لحزب الحرية والعدالة بتوزيع دعاية للتصويت ب"نعم" على الدستور ،وفي محافظة كفر الشيخ أمام مدرسة اللواء فتح الله سلام بمركز دسوق وجود مجموعة من المواطنين من أنصار حزب الحرية والعدالة يقومون باستخدام مكبرات صوت لحث المواطنين للتصويت لصالح "نعم" للدستور ،وفي محافظة السويس بمدرسة محمد عبده القديمة بحي السادات وجود دعاية انتخابية على أسوار المدرسة للتصويت ب"نعم" للدستور ،وفي محافظه دمياط بلجنتي (4 و5) بمدرسة النصر الإعدادية وجود ملصقات على سور المدرسة مثل "الدعوة السلفية تدعوكم للتصويت بنعم للدستور" و "نعم للشريعة والاستقرار". واوضح التقرير وجود أخطاء داخل اللجان ،في محافظة كفر الشيخ بمدرسة اللواء فتح الله سلام بمركز دسوق عدم استخدام الحبر الفسفوري وعدم وجود ستائر في اللجنة. كما تم منع مراقبي المجتمع المدني في محافظة البحر الأحمر، حيث تم طرد مراقبي منظمات المجتمع المدني من لجنة مدرسة التربية الفكرية بالغردقة من قبل القاضٍ المشرف على الانتخابات دون إبداء أسباب واضحة لذلك ،وفي محافظة القليوبية شهدت لجان أرقام ( 33، 34 )بمدرسة صنافير الابتدائية للتعليم الأساسي منع دخول المراقبيين من قبل رئيس اللجنة وبمعاونة أحد الأشخاص، وذات الأمر بمدرسة ملحقة المعلمين الابتدائية، حيث قامت قوات الأمن بمنع المراقبين من دخول اللجنة العامة رغم حصولهم على تصاريح بالمراقبة. وأعرب التقرير عن اسفه من وجود أعمال العنف ومشادات كلامية في محافظة الجيزة، حيث رصد مراقبون التحالف بلجنة رقم (42) بمدرسة عمرو بن العاص بالجيزة حدوث مشادات كلامية بين الناخبين لتسابقهم حول أولوية الدخول للجنة مما أدي إلى تدخل رجال الشرطة وقاموا بعمل حاجز بين الرجال والنساء أمام اللجنة، مطالبين إياهم بالتزام الهدوء لسرعة الانتهاء من إدلاء جميع الناخبين بأصواتهم، دون الحاجة إلى الاشتباك أو المشادات الكلامية ،و أمام مدرسة محمد كريم بالمنيب حدوث مشادات كلامية بين الناخبين المتواجدين والقاضٍ المشرف على لجنتي ( 44 و 45) بسبب تأخر فتح اللجان لمدة 30 دقيقة. كما رصد مراقبون التحالف توجيه الناخبين في محافظة القليوبية بمدرسة كفر الدير الإعدادية المشتركة قيام أشخاص منتمين لجماعة الأخوان المسلمين بتوجيه الناخبين والناخبات داخل وخارج اللجان للتصويت ب"نعم"، وبلجنة رقم (9) بمدرسة المنطقة الوسطي الابتدائية بالجبل الأصفر بالخانكة قام رئيس اللجنة بحث الناخبين على التصويت لصالح "نعم"، بالإضافة إلى وجود توجيه للناخبين أمام اللجان باستخدام لاب توب تابع لحزب الحرية والعدالة، وبمدرسة القلج الثانوية المشتركة تواجد مجموعة من أنصار جما عة الأخوان المسلمين داخل وخارج اللجان للتصويت لحث المواطنين على التصويت ب"نعم"، وكذا بمدرسة عمرو بن العاص بالقلج حيث رصد حالات توجيه للناخبين داخل وخارج اللجان للتصويت ب"نعم" ،وفي محافظة كفر الشيخ، رصد مراقبون التحالف بمدرسة اللواء فتح الله سلام بمركز دسوق وجود توجيه للناخبين داخل اللجان من قبل أنصار جماعة الأخوان المسلمين حاملين لتصاريح مراقبة من المجلس القومي لحقوق الإنسان، كما رصد مراقبو التحالف وجود أشخاص يوجهون الناخبين للتصويت ب"نعم" للدستور على بعد 50 متر من لجان المدرسة، وذات الأمر أمام مدرسة سعد زغلول الابتدائية حيث تواجد العشرات من المواطنين من أنصار التيار السلفي الذين يقومون بتوجيه الناخبين للتصويت لصالح "نعم " للدستور. وأشار التقرير الي وجود نقل جماعي في محافظة الفيوم حيث رصد المراقبون وجود عمليات نقل جماعي للناخبين باستخدام سيارات تحمل لوحات معدنية بأرقام (41176 أجرة الفيوم – 4110 أجرة الفيوم – 499 أجرة الفيوم) وذلك أمام لجان (مدرسة الراضي، مدرسة الساحة، مدرسة بني عتمان) بمركز سنورس.