كشفت تحقيقات نيابة المطرية، التى باشرها المستشار معتز جمال أباظة، وكيل النائب العام فى قضية"خلية ظلال القرآن"، أن المتهمين اعتنقوا أفكار سيد قطب، حيث ضبط بحوزتهم عدد كبير من هذه الكتب. كما ضبط أيضًا منشورات، وكتب تحت مسمى "الجهاد، وشارات رابعة وصور للرئيس المعزول محمد مرسى، وكمية من الهواتف المحمولة وأسلحة نارية وبيضاء وكمية من البارود".
وأثبتت التحريات التى قدمت للنيابة العامة، أن المتهمين كانوا يعتصمون بميدان رابعة والنهضة ويخرجون فى مسيرات مناهضة للجيش والشرطة وتطالب أيضًا بعودة الرئيس الأسبق محمد مرسي.
أكدت التحريات أن المتهمين كانوا يعقدون اجتماعات سرية لحشد المظاهرات والتخطيط لأعمال عنف ضد الدولة وحرق المنشآت الحيوية وتعطيل المرور. كانت النيابة قد أمرت بحبس 3 من أعضاء الخلية15 يوما على ذمة التحقيق، كما أمرت المباحث بسرعة ضبط وإحضار 9 آخرين ينتمون للخلية ثبت اشتراكهم فى عدة أعمال عنف.
جاء أمر الحبس بعد ورود تحريات الأمن الوطني والمباحث حول اشتراكهم فى عدة مسيرات مناهضة تهدف لقلب نظام الحكم، وفجرت التحقيقات عن مفاجأة، حيث أثبت التحريات عن تخطيط المتهمين لإفساد زيارة الرئيس عبد الفتاح السيسى لجامعة القاهرة أمس.
ونسبت النيابة للمتهمين تهم الانضمام لجماعة إرهابية وحيازة أسلحة، ومتفجرات وقلب نظام الحكم وإثارة الشغب والفوضى وتكدير السلم العام. كانت قوات الأمن قد ألقت القبض عليهم بعد استصدار إذن من النيابة وذلك بعد ورود معلومات تفيد تكوينهم خليه إرهابية تهدف لإثارة العنف.