بعد اختيار فايزة ابو النجا مستشارة للأمن القومي، من قبل رئيس الجمهورية عبد الفتاح السيسي اثار القرار العديد من التساؤلات والتعقيبات لدى الإعلام والشارع المصري. وعلق الكثيرون على القرار ولكن الغالبية اتفقت على ان القرار في محله وصائب كعادة الإعلام المصري دائما ، وفيما يلي اهم تعليقات الإعلاميين على القرار. يوسف الحسينى قال الإعلامي يوسف الحسيني، إن الرئيس أصدر قرارا بتعيين فايزة أبو النجا مستشارا للرئيس للأمن القومي، معقبا على القرار بقوله: "لكنني أنا، وكل من انتخب الرئيس السيسي، من حقنا أن نتعجب من هذا القرار، ونسأل عن معايير اختيار الرئيس لمستشاريه"، وذلك في برنامجه "السادة المحترمون"، المذاع على شاشة "أون تي في" الفضائية. وتابع الحسيني قائلا: "أرفض الحالة الداعشية التي يفرضها البعض علينا، ويقول لا تسأل ولا تتكلم، بحجة أنه أمن قومي، فنحن لا بد أن نعرف الأسباب طالما لم تمس الأمن القومي، وأكيد المعايير دي لا تمسه، مش كل حاجة هتبقى أمن قومي". تامر أمين وبدوره، أشاد الإعلامي تامر أمين بقرار الرئيس عبدالفتاح السيسي، بتعيين فايزة أبو النجا مستشارا للرئيس للأمن القومي، وأكد خلال برنامجه "من الآخر"، المذاع على فضائية "روتانا مصرية"، أن القرار صائب، خصوصا أن فايزة أبو النجا من الشخصيات التي خدمت مصر كثيرا، ولم تتلوث يوما، ولم تتورط في الفساد، كما بذلت العديد من المجهودات في توفير المعونات والمساعدات لمصر طوال تاريخها. مصطفى بكري أشاد الإعلامي مصطفى بكري بتعين فايزة أبو النجا مستشارا للأمن القومي، واصفها إياها بأنها امرأة بمليون رجل، مشيرا إلى أنها تحدت أمريكا بكل شجاعة، وأن القرار أكثر من رائع، وذلك في برنامجه "حقائق وأسرار"، الذي يعرض على قناة "صدى البلد". أحمد موسى وأشاد الإعلامي أحمد موسي، في برنامجه "على مسؤوليتي"، المذاع على "صدى البلد "، باختيار الرئيس للدكتورة فايزة ابو النجا مستشارا لرئيس الجمهورية للأمن ومكافحة الإرهاب، مشيرا إلى أنه اختيار موجع لكل المتآمرين الذين تلقوا أموالا من الخارج، ويعملون لصالح القوى المعادية. وأوضح موسى أن الدولة المصرية سيادية، ورئيسها يتخذ القرارات بناء علي المصلحة الوطنية والعليا للبلاد، دون النظر إلى أي عداء خارجي أو داخلي، خصوصا أن الصحف الأمريكية تصف أبوالنجا بأنها السيدة المعادية للولايات المتحدة. خيرى رمضان ومن جانبه، قال الإعلامي خيري رمضان، إنه كان من الضروري إعلان سبب تعيين فايزة أبو النجا في هذا المنصب، نزولا على رغبة المواطنين، وتابع: "لماذا نترك المجال أمام الميديا للنقد، بالرغم من التاريخ المشرف لفايزة أبو النجا؟" مؤكدا أن القرار عظيم، وأنه كان من المفترض طرح بيان من الجهات الرسمية به، ومنحه لوسائل الإعلام كافة، وذلك عبر برنامجه "ممكن"على فضائية "سي بي سي". محمد الغيطي قال الإعلامي محمد الغيطي، في برنامجه "صح النوم" على شاشة "التحرير" الفضائية، إن الدكتور فايزة أبو النجا من الشخصيات التي تصدت للاختراق المخابراتي والتمويل الأجنبي، ومن أهم ممثلي الكرامة المصرية، مشيرا إلى أن الرئيس السيسي على معرفة جيدة بما يتخذه من قرارات.
