اتهم مصطفى بكري، جماعة الإخوان بأنهم من يدعمون داعش، وأن داعش خرجت من رحم الإخوان، وأضاف في حلقة من برنامجه (حقائق وأسرار) على فضائية صدى البلد، أن داعش جماعة إرهابية له نفس أغراض جماعة الإخوان وهي تقسيم الشرق الأوسط وتنفيذ المخطط الأمريكي، معتبرًا أن كلاً من داعش والإخوان أدوات أمريكية وتم تكوينهم على أساس الطائفية والعرقية واستطرد بكري، أن أمريكا دعمت جماعات إرهابية عديدة مثل النصرة في العراق وغيرها، وارتكبت جرائم عديدة في حق الشعب العراقي وإسقاط نظام الرئيس صدام حسين، لافتًا أنه نفس الدور الذي أرادت أن تلعبه في مصر بواسطة جماعة الإخوان ولكنها فشلت لوجود جيش قوي حمى البلاد وفقًا لقوله .