رد مرجان سالم القيادي ب "السلفية الجهادية" بعنف على اتهامات الجهادي نبيل نعيم للسلفية الجهادية بالتورط في حادث اغتيال اللواء محمد إبراهيم وزير الداخلية، وأصفًا إياها بأنها "اتهامات جوفاء لا أساس لها من الصحة تحركها أهداف مشبوهة". استنكر بشدة وصف نعيم بأنه "مؤسس جماعة الجهاد"، قائلاً إنه "لم يكن يومًا فقط أحد المتهمين في قضايا الجهاد، ولم يكن قياديًا يومًا في الجماعة له علاقة بتأسيس الجماعة". أوضح سالم أن "نعيم دخل السجن خلال سبعينات القرن الماضي في قضية جنائية حيث كان وصفه في الفيش والتشبيه بمطفش خزن لتورطه في جرائم سرقة ونهب"، على حد قوله. اعتبر أن "حديثه عن الصلات الوثيقة بينه وبين الشيخ أسامة بن لادن زعيم "القاعدة" الراحل وخلفه الدكتور أيمن والظواهري ما هو إلا مسعى لتسويق نفسه".