استنكرت وزارة الأوقاف بشدة الاعتداء الإرهابي الغاشم على كنيسة العذراء بالوراق وأكدت في بيان لها الاثنين 21 أكتوبر، أن مثل هذه الاعتداءات الآثمة مخالفة لكل الشرائع والقيم الإنسانية. وأضاف البيان أنه ينبغي الضرب بيد من حديد علي مرتكبيها، كما ينبغي على سائر الهيئات العلمية والتعليمية والثقافية أن تقوم بدورها للتوعية بأهمية الوحدة الوطنية، وخطورة الفتن على الفرد والمجتمع، مؤكدة أن هذه الظواهر السلبية غريبة على شريعتنا وقيمنا وحضارتنا ووحدتنا وتماسكنا كأبناء وطن واحد. ودعت الوزارة الأئمة والخطباء بأن يركزوا فى دروسهم الدينية وفى الخطبة الثانية من الجمعة القادمة على ما يدعم أواصر الوحدة الوطنية.