قامت الوحدة المحلية لمركز ومدينة الفشن بوقف بناء كنيسة عزبة جعفر، لعدم التزامها بشروط ترخيص البناء، كما تواجدت الشرطة وقوات الأمن تحسبا لحدوث أية مصادمات مع مسئولي الوحدة المحلية. وقد علمت "بوابة الأهرام" أن هناك قرارا جمهوريا بالسماح ببناء كنيسة عزبة جعفر بمركز الفشن وبناء على القرار بدأت أعمال البناء، إلا أن الوحدة المحلية بالفشن أوقفت البناء فى 18/9/2010 لمخالفة شروط الترخيص وعدم الالتزام بالمواصفات المحددة، إلا أنه تمت إعادة استكمال البناء بنفس المواصفات التى تم الوقف من أجلها، مما اضطر الوحدة المحلية لاتخاذ قرار الوقف للمرة الثانية. فيما أكد العميد أحمد عيطة، رئيس مركز ومدينة الفشن، أنه بالفعل يوجد قرار جمهورى بإنشاء كنيسة جديدة بدلا من الكنيسة القديمة التى تمت إزالتها وتم التصريح من الوحدة المحلية بالبناء وبنفس المواصفات التى حددها القرار الجمهورى، غير أن القائمين على العمل خالفوا الشروط وبنفس المخالفات، فاضطررنا لإبلاغ الجهات الأمنية ومحافظة بنى سويف والأنبا اسطفانوس راعى كنيسة ببا وسمسطا والفشن، لإيقاف المبانى مرة أخرى. هذا ومازالت قوات الأمن متواجدة بالقرية تحسبا لوقوع أى مصادمات وهو الأمر الذى نفاه الأهالى من المسلمين والمسيحيين، وأكدوا على وحدة القرية، أما هذه فمشكلة إجراءات وروتين ليس أكثر.