أكد الشيخ "محمد عبدالله نصر" المنسق العام لائتلاف "أزهريون مستقلون"، أن انضمام وزارة الأوقاف ودار الإفتاء المصرية إلى الأزهر مطلب كل عالم أزهرى غيور على المرجعية الإسلامية الوسطية بعد ثورة 25 يناير، مطالبين بإلغاء كل من وزارة الأوقاف ودار الإفتاء ونقل تبعيتهم للأزهر من خلال تعيين وكيلين لشيخ الأزهر الأول وكيل لشئون الإفتاء والآخر وكيلاً لشئون الدعوة. ومن جانبه استنكر نصر فكرة أن يكون الأزهر تابعًا لأى مؤسسة أخرى، مضيفًا أن هناك مساعى دائمة من قبل جماعة الإخوان المسلمين لتهميش دور الأزهر ونقل تبعيته للأوقاف؛ نظرًا لسهولة السيطرة عليه خاصة فى ظل وجود وزير الأوقاف ذى الميول الإخوانية.