"جامعة النيل" تتمكن من تحليل بيانات أربعة أنواع من جينوم نخيل البلح

تمكن فريق المعلوماتية الحيوية بجامعة النيل من تحليل بيانات أربعة أنواع من جينوم نخيل البلح المصري وإخراج نسخة مبدئية من هذا الجينوم وذلك بالتعاون مع باحثي معهد بحوث الهندسة الوراثية التابع لمركز البحوث الزراعية.
ويعتبر ذلك الإنجاز بداية لتطبيق أحدث تقنيات تحديد تتابعات القواعد النيتروجينية في الحفاظ على الثروة الوراثية من أصناف النخيل المصرية.
كما إن تحديد تتابعات الجينوم يمكن الباحثين لاحقا من تحديد العوامل الوراثية المسئولة عن العمليات البيولوجية المرتبطة بالإنتاجية والجودة مما يساعد في إيجاد طرق لتحسين الإنتاجية وتقليل الفاقد في المحصول.
كما يساعد في التحديد الدقيق للأصناف المرغوبة تجاريا وزيادة المحصول عن طريق التنبؤ المبكر بجنس أشجار النخيل المزروعة.
واستخدم فريق المعلوماتية الحيوية بجامعة النيل أجهزة حاسبات عالية القدرة لتحليل البيانات وذلك بغرض تحديد الخريطة الجينية والمكونات الوراثية المهمة في جينوم النخيل بالإضافة لدراسة التباين الوراثي بين هذه الأصناف.
وسوف يستمر التعاون مع باحثي معهد الهندسة الوراثية بمركز البحوث الزراعية من أجل التوسع في تحديد المحتوى الوراثي لعدد أكبر من الأصناف المصرية والمساهمة في جهود الحفاظ عليها من الاندثار.
وقال الدكتور طارق خليل رئيس جامعة النيل:" إن هذا المشروع هو أحد الامثلة على اهتمام الجامعة بالبحث العلمي التطبيقي للمعلوماتية من أجل إيجاد حلول تخدم الاقتصاد المصري، وهو كذلك مثال ناجح لتعاون فرق الجامعة البحثية مع المؤسسات البحثية الأخرى".
وأضاف الدكتور محمد أبوالهدى رئيس فريق المعلوماتية الحيوية بالجامعة إن هذا المشروع هو أحد مشاريع الجينوم التي تطلب بنية حسابية متقدمة تم توفيرها وبناؤها في مركز المعلوماتية بجامعة النيل على يد باحثي الجامعة.
وهذه البنية التحتية تشمل حواسب متقدمة مع ربطها بأنظمة الحوسبة السحابية. وتلك المشاريع تندرج تحت ما يعرف حديثا بمعالجة البيانات الضخمة (Big Data) حيث يتم استعمال عدد كبير من المعالجات على التوازي لتنفيذ العمليات الحسابية بشكل أسرع، وهو ما يشير إلى ريادة جامعة النيل في مجال تحليل البيانات الضخمة.
وعن المشروع يقول الباحث حاتم الشاذلي أنه شارك في المشروع بعد حصوله على تدريب مكثف في فريق المعلوماتية الحيوية وبعد انضمامه لمشاريع مشتركة لتحليل البيانات الحيوية بين فريق المعلوماتية بجامعة النيل وفريق بحثي من جامعة هارفارد، مما أعطى له الخبرة اللازمة للتعامل مع تلك النوعية من البيانات الكبيرة الحجم.