قبل ساعات من بداية الأسبوع الثاني للدراسة قرر الدكتور عبدالعظيم وزير محافظ القاهرة غلق فصلين دراسيين بمدرستي سانت كلير بمصر الجديدة ومدرسة المعارف الخاصة بالزيتون بعد أن تبين إيجابية العينات التي تم أخذها من طالب وطالبة، وكان أولياء أمور الطلاب قد قاموا بالتوجه للمستشفيات لتوقيع الكشف علي أبنائهم لتشككهم في إصابتهم بفيروس H1 N1 وتبين إصابة الطالب والطالبة بمرض أنفلونزا الخنازير، وتفقد المحافظ المدرستين اللتين وقعت بهما الإصابات.. وأصدر تعليمات لمديري المدرستين بغلق الفصلين الدراسيين وإخطار أولياء الأمور بعدم الحضور للمدرسة 15 يوماً وأن تقوم مديرية الشئون الصحية بمتابعة حالة المصابين بزيارتهما في منازلهما وتوقيع الكشف الطبي علي المخالطين لهم بالمنزل. من ناحيته استبعد الدكتور عاطف العوام نائب رئيس جامعة عين شمس لشئون التعليم والطلاب أن تقوم الجامعة بأي إجراءات "استثنائية" أو وقف للدراسة في كليات الجامعة بعد الكشف عن إصابة طالبتين بالجامعة بمرض أنفلونزا الخنازير، وقال العوام إن الحالتين تم الكشف عنهما خارج أسوار الجامعة وان إحدي الطالبتين المصابتين بأنفلونزا الخنازير هي شقيقة الطالب المصاب بمدرسة المعارف وانهما كانا قادمين من ماليزيا. قال العوام إنه لن يتم التحليل الطبي للطلبة الموجودين داخل الكليات التي تم الكشف عن حالات الإصابة بها لأن الطالبتين المصابتين تم الكشف عنهما داخل منازلهما أي بعيداً عن الجامعة ككل، قائلاً: "إن إحنا هنحلل لمين ولا لمين". وحول متابعة وزارة الصحة لانتشار فيروس أنفلونزا الخنازير بين طلاب المدارس قال الدكتور نصر السيد مساعد وزير الصحة للشئون الوقائية إن خطة الوزارة تقوم علي رصد جميع طلاب المدارس البالغ عددهم 17 مليون تلميذ وتلميذة بمدارس الجمهورية، قال السيد إن ظهور حالات بين الطلاب في المدارس والجامعات كان متوقعاً، مؤكداً علي التنسيق بين وزارات الصحة والتعليم والتعليم العالي.