من الاضرار التي تنتج عن تلوث المياه واهم هذه الاضرار هي صحة الانسان من خلال اصابته بالعديد من الامراض الناتجة عن هذا التلوث ومن هذه الامراض الكوليرا و التيفود و الدوسنتاريا بكافة انواعها و الالتهاب الكبدي الوبائي و الملاريا و البلهارسيا و امراض الكبد و حالات تسمم وتشمل الاضرار الناتجة عن تلوث المياه الاضرار المؤثرة في الحياة ككل مثل مياه الانهار والبحيرات وذلك بنمو الطحالب عن طريق المخلفات الزراعية الملقاة في المياه مما يؤثر سلبا على الاسماك لان الطحالب تحجب الشمس والاكسجين للوصول الى الاسماك كما انها تعتبر بؤرة لتكاثر الحشرات الضارة مثل البعوض فى مياه الانهار والبحيرات والتي تسبب مرض البلهارسيا وعدا عن ان تلوث المياه يلحق الضرر بالثروة السمكية فانه يؤثر على الكائنات الحية كهجرة طيور كثيرة نافعة و الاضرار بالشعب المرجانية والتي بدورها تؤثر على السياحة وهنالك آثار اقتصادية منها تكلفة الدولة وقلة انتاجها وحدوث المشاكل الصحية هي مشكلة في حد ذاتها