واصلت الكنائس الارثوذكسية بانحاء الجمهورية تلقيها للعزاء في وفاة البابا شنودة الثالث فقد اقامت كل مطرانية وكنيسة عزاء خاص بها بعد انتهاء الكاتدرائية المرقسية من قبول العزاء رسميا. وقد اقامت عائلة قداسة البابا المتنيح عزاء بكنيسة السيدة العذراء بجاردن سيتي باعتبارها اول كنيسة اسسها قداسته عقب توليه منصب البطرك وتقبل العزاء عادل وعاطف روفائيل جيد نجلا شقيق البابا وحضره الانبا باخوميوس القائم مقام البطريرك والاباء يؤانس سكرتير البابا وثيودسيوس اسقف الجيزة وموسي اسقف الشباب.. كما حضر الشيخ سعد عمارة مندوبا من الأزهرو الشيخ محمود عاشور وكيل الأزهر السابق والمهندس حسين مسعود وزير الطيران المدني ود. علي صبري وزير الانتاج الحربي ود. احمد درويش وزير التنمية الادارية السابق ود. عبدالقوي خليفة محافظ القاهرة ود. عبدالرحيم شحاتة المحافظ السابق وهاني عزيز مستشار وزير القوي العاملة والهجرة ود. مصطفي الفقي والاعلامي مفيد فوزي.. من ناحية اخري اقام الانبا روفائيل عزاء اخر بالبطرخانة او البطريركية القديمة بشارع كلوت بك بالازبكية. ومن جانب آخر صرح الانبا بيشوي سكرتير المجمع المقدس انه تم ارسال خطاب للمشير حسين طنطاوي رئيس المجلس العسكري للتصديق علي قرار اختيار الانبا باخوميوس اسقف البحيرة ومطروح كقائم مقام البطرك لحين اختيار البابا القادم واصدار قرار رئاسي بالتعيين. واضاف انه عقب ذلك يحق للانبا باخوميوس ان يستلم مكاتب القلاية الخاصة بالبابا شنودة المتنيح بدير الانبا بشوي والكاتدرائية بالعباسية. وقال ان الانبا باخوميوس سوف يمارس عمله من المقر البابوي بالكاتدرائية بدلا من البحيرة وانه سوف تقام صلاة الاربعين علي روح البابا شنودة يوم 52 إبريل في الساعة الثامنة صباحا بالكاتدرائية بالعباسية وفي اليوم التالي بدير الانبا بيشوي بوادي النطرون.