أوضح مركز ابن خلدون للدراسات وجود بعض المخالفات فى مقر التصويت على الانتخابات, ومنها: "استطلاع رأي أمام اللجنة بالجيزة في فيصل بمدرسة حمزة بن عبدالمطلب وهو ما يعد مخالفة للقانون". أشار المركز إلى أنه يوجد لجنتا 14 و15 بمدرسة المقطم التعليم الأساسى يديرهما مستشار واحد, كما يوجد قاضٍ يحمل سلاحاً داخل اللجنة بمدرسة بلقاس الإعدادية ببلقاس بمحافظة الدقهلية لجنة 45, وتقوم مستشارة بتعطيل عملية التصويت بلجنة 51 مدرسة عزيز اباظة بمنطقة أرض الجولف القاهرة". رصد المركز لجاناً عدة تأخرت فى فتح أبوابها، منها لجنة 37 قرية حلوة مدرسة حلوة الإعدادية بالمنيا, تأخر فتح اللجان للساعة 10 صباحاً, ويطالب مركز ابن خلدون غرفة عمليات وزارة الداخلية بتوفير مظلات خارج اللجان، حيث إن الإقبال بدأ بالضعف نتيجة الطوابير الطويلة أمام اللجان. وأعلن المركز عن تصريح من حملة السيسي ينفى تعرضه للاعتداء, وأكد أن ما تم ترويجه حول محاولة الاعتداء على السيسي غير صحيح، وأنه كان شخص أتى مندفعاً وتم تفسيره خطأً.