منذ مناقشتها أثارت المادة 97 من اللائحة الداخلية للبرلمان الجدل، بحسب ما صرح به النائب البرلماني، محمد ماهر، والذي أشار إلى أن الخلاف بسبب أن اللائحة الداخلية للمجلس كانت تنص على أن يتكون الائتلاف من 20% من أعضاء مجلس النواب على مستوى 15 محافظة إلا أن الأغلبية وافقت على أن يكون الائتلاف من 25% من النواب فى 15 محافظة. وأكد "ماهر" فى تصريحات خاصة ل"المصريون" تم تأجيل القرار النهائي بشأنها لحين الانتهاء من وضع اللائحة الداخلية للمجلس موضحًا أن الأغلبية وافقت على ذلك وهو ما ترتب عليه توجيه الاتهامات للائتلاف دعم مصر بأنه يسعى إلى تكوين حزب وطني جديد داخل المجلس خاصة أنه صاحب الأغلبية. وأشار إلى أن الاعتراض يأتي من قبل عدد قليل من المعارضين مشيرًا إلى بعض التوجهات لعمل ائتلافات جديدة تحت قبة البرلمان بالإضافة إلى ائتلاف "دعم مصر". ومن جانبه، كشف البرلماني، الدكتور أيمن أبو العلا، عن جمع توقيعات من النواب الرافضين للمادة للمطالبة بإعادة مداولتها مرة أخرى فى الجلسة العامة، اعتراضًا على تمريرها، وذلك بناء على الاجتماع السابق الذي عقدة رئيس المجلس مع الرافضين لهذه المادة فى حضور رئيس ائتلاف دعم مصر اللواء سامح سيف اليزل ونائبه أسامة هيكل، وأكد خلاله "عبد العال" بأن اللائحة لن تمر إلا بعد أن يتوافق عليها جميع النواب. وأعلن عن بدء اتصالات مع عدة أحزاب ممثلة فى البرلمان لتدشين تحالف جديد، وأبرز تلك الأحزاب "الوفد – حماة الوطن – المحافظين" مشيرًا إلى التركيز على المستقلين لأنهم أصحاب الكتلة الأكبر تحت قبة البرلمان قائلا: "لدينا مجموعة كبيرة من المستقلين أعلنوا دعم فكرة الدخول فى التحالف الذي يسعى المصريين الأحرار لتشكيله". وتابع أنه لم يتم الاستقرار على اسم للتحالف حتى الآن، وأن الهدف الأول من تشكيل التحالف هو الوصول إلى ممارسة برلمانية قوية. وفى السياق نفسه، قال النائب ضياء داود، عضو مجلس النواب: إن ائتلاف "25- 30" ينتظر طلب إعادة المداولة لهذه المادة مشيرًا إلى أن هناك أحزابًا كبيرة رفضت المادة قائلاً إنه على ضوء قواعد اللائحة فسنحدد تحركاتنا بشأن الائتلاف تشكى الائتلاف.
وأوضح أنه حال رفض عدم تعديل المادة الخاصة بتشكيل الائتلافات فلا يشترط أن يكون الائتلاف قانونيًا، مؤكدًا التحول إلى تكتل تحت قبة البرلمان. فيما قال، حسام الخولى، نائب رئيس حزب الوفد: "حاليًا لم نناقش الدخول فى ائتلاف أو تشكيل تحالف، واعتراضنا على تلك المادة لأنها لا تخص المجلس الحالى فقط ولكنها مستمرة للبرلمانات المقبلة". وأضاف "الخولي" "الحزب لم يتحدث عن نسبة 5% مثلاً لتكوين الائتلاف حتى يتمكن الوفد من تشكيل ائتلاف بشكل سريع حال التفكير فى ذلك، ولكن تحدثنا عن نسبة 15% وهى نسبة طبيعية ومتزنة ومعقولة تصلح للبرلمانات المقبلة. وأشار إلى أنه لم ترد له اتصالات من المصريين الأحرار بخصوص تشكيل تحالف جديد، وننتظر مناقشة المادة 97 الخاصة بتشكيل الائتلافات مرة أخرى وبعدها نُقيم كل الأمور.