أشار مصطفى طلعت الشافعي، رئيس مكتب رئيس ديوان رئاسة الجمهورية الأسبق، إلى أنه صدر تعليمات بنقل أرشيفات إدارات رئاسة الجمهورية من مقر حفظها ب"قصر الاتحادية الرئاسي" إلى "قصر عابدين" قبل الثلاثين من يونيو 2013. وتابع الشافعي، بأن القرار أصدره رئيس ديوان رئيس الجمهورية بعد الاستناد على مذكرة أعدتها إدارات الأمن والتأمين المختصة بالرئاسة، مرجعاً ذلك القرار إلى انخفاض سور "الاتحادية" مع تعالي نبرة الاحتجاج في تلك الفترة أدى إلى ضرورة ذلك الإجراء حفاظًا على الوثائق والأشخاص. وأبدى الشاهد اعتقاده بأن رئيس الديوان عرض القرار على رئيس الجمهورية حينها (الرئيس المعزول) وأنه وافق عليه، مشددًا في الوقت ذاته على أنه من المستحيل أن يتم اختلاس أي وثيقة أثناء النقل عبر القائمين على ذلك لأن كل مستند كان مدونًا حينها ومعروف في عهدة مَن. وأشار "الشافعي" إلى أن الأرشيفات حينها لم يكن بها أي مستندات سرية، لافتًا إلى أن أرشيف مكتبه تم نقله ل"عابدين" بالفعل، وعن أرشيف "مكتب الرئيس" أبدى الشاهد عدم معرفته بما تم حياله وهل تم نقل أرشيفه من عدمه.