استنكر ائتلاف أقباط مصر تصريحات رئيس الوزراء التركي رجب طيب أردوغان، والتي طالت شخص شيخ الأزهر الكريم أحمد الطيب، التي ادعى خلالها أن التاريخ سيلعن أمثال شيخ الأزهر لمواقفه المؤيدة للقوات المسلحة، والتي يزعم أردوغان أنها مؤيدة للانقلاب العسكري. وأعلن ائتلاف أقباط مصر كامل تقديره واعتزازه واحترامه لشخص الدكتور أحمد الطيب، شيخ الأزهر، الكريم ولمقام ومكانة الأزهر الشريف في مصر وجميع أنحاء العالم بل وحفظًا لحق رجال الأزهر الشرفاء. وأكد ائتلاف أقباط مصر متمثلًا في جميع أعضائه المسلمين والمسيحين وبكل لجانه وفروعه ال 16 رفضه لتصريحات أردوغان، لأنها لا تخرج إلا عن أناس متربصون بمصر وشعبها ورموزها الدينية التي لها كامل الاحترام والتقدير. وأوضح الائتلاف أن تطاول أردوغان على الأزهر وشيخه يأتي في إطار هذا المنهج الساعي لتشويه كل مخالف للإخوان فعندما لمس أردوغان أن انتقاداته لم تؤثر في الجيش المصري سعى للتطاول على الأزهر وشيخه. وشدد على أن تطاول أردوغان ليس شطحة من شطحاته المعهودة بل إنها من صميم مخطط الإخوان الساعي لتدمير مؤسساتنا، وتشويه سمعتها وهذا ما نرفضه جملة وتفصيلًا ونطالب بموقف العلاقات المصرية التركيبة حتى يتم محاسبه هذا الشخص عن تصريحاته غير مسئولة وتحذيره بعدم التحدث عن مصر وشعبها ورموزها لأن قامتهم أعلى منه ومن أتباعه.