هناك بعض الأسباب الطبية، التي تؤدي إلى النوم المتقطع، وتتمثل في: 1- الشعور بالقلق والاكتئاب أو بعض المشكلات النفسية. 2- الشعور بحرقة في المعدة نتيجة تناول وجبة طعام ثقيلة قبل النوم. 3-- الإصابة بمرض الغدة الدرقية. 4- مرض السكري من حيث ارتفاعه أو انخفاضه. 5- أمراض القلب. 6- الإصابة بالاضطرابات العضلية والهيكلية. 7- التبول المتكرر أثناء الليل. 8- الشعور بمشاكل في التنفس 9- الصداع الشديد. 10- ارتفاع درجات الحرارة مما يؤثر على صحة الجسم.