استنكرت وزارة الأوقاف ما يقوم به ما يسمي بالاتحاد العالمي لعلماء المسلمين الذي يرأسه الشيخ يوسف القرضاوي معتبرة انه خرج عن المسار الصحيح بما يضر بمصلحة الوطن ومطالبة بحل فرعه في القاهرة. وأوضحت الوزارة في بيان لها الأربعاء 5 ديسمبر أن اتحاد علماء المسلمين قد خرج عن مساره العلمي الدعوي وصار ذراعا سياسيا للتنظيم الدولي للإخوان المسلمين وقد أنشئ ضررا للأزهر الشريف، ولكن لن ينال مطلقا من دوره. كما انتقد البيان تصرف القرضاوي باعتباره إخوانيا ينتمي إلى هذا التنظيم الدولي، وهجومه على الأزهر ومؤسسته الوسطية العريقة تارة، وتحريضه على ما يخل بأمن الوطن واستقراره تارة أخرى. كما استنكرت الوزارة تجاوز الشيخ القرضاوي في حق الوطن و الأزهر الشريف.