ثورة 30 يونيو كانت من أهم ثمارها قرار اعادة بناء الكنائس التي دمرتها الجماعات المتطرفة، بالاضافة الي صدور قرار آخر لا يقل أهمية ويحمل رقم 199 في 26 يناير 2017 بتشكيل لجنة وزارية لتوفيق أوضاع الكنائس المنصوص عليها وفقا لقانون بناء الكنائس الذي أقره مجلس النواب في سبتمبر 2016. وهذه الجهود تهدف الي ترسيخ قيم ومبادئ المواطنة وحرية العبادة والمساواة بين جميع المصريين وتأكيداً علي التعايش المشترك لكل المواطنين والتزاماً في الوقت نفسه بما نص عليه الدستور المصري، وهو ما أكد عليه رئيس الجمهورية خلال فعاليات منتدي شباب العالم في نوفمبر 2018 عندما قال: أخرجنا قانون بناء الكنائس في مصر، وأصبحت الدولة لأول مرة معنية ببناء الكنائس لمواطنيها لأنهم لديهم الحق في العبادة. وتشكل اللجنة برئاسة رئيس الوزراء، وعشرة أعضاء، ستة من الوزراء هم: وزراء الدفاع والإنتاج الحربي، الإسكان والمجتمعات العمرانية، التنمية المحلية، الشئون القانونية ومجلس النواب، العدل، والآثار، كما ضمت اللجنة ثلاثة ممثلين عن: المخابرات العامة والرقابة الإدارية، والأمن الوطني بوزارة الداخلية، بالإضافة إلي ممثل واحد عن كل طائفة معنية. وتجتمع هذه اللجنة كل شهرين للنظر في طلبات تقنين الكنائس ودراستها بصورة مستفيضة، وارسال لجان هندسية للتأكد من السلامة الانشائية. وبدأت اللجنة أعمالها في سبتمبر عام 2017 واعتمد مجلس الوزراء اول قرار لها في فبراير عام 2018 بتقنين أوضاع 53 كنيسة ومبني خدميا تابعاً. وفي أبريل من نفس العام تمت الموافقة خلال اجتماع اللجنة العليا لتقنين أوضاع الكنائس علي تقنين أوضاع 166 حالة منها 102 كنيسة و64 مبني خدميا تابعا في عدد من المحافظات. وفي أكتوبر عام 2018 وافق مجلس الوزراء علي قرار اللجنة بتقنين أوضاع 120 كنيسة ومبني، ليبلغ بذلك عدد الكنائس والمباني التي تم توفيق أوضاعها 340. اما في نوفمبر فقد وافقت اللجنة في اجتماعها علي تقنين أوضاع 168 كنيسة ومبني، منها 151 كنيسة ومبني تم تقنين أوضاعها بشكل نهائي، و17 كنيسة ومبني تم تقنين أوضاعها بشرط استيفاء متطلبات السلامة الإنشائية، بعد إثبات أنها غير مقامة علي أراض ملك للدولة أو أراض وقف أو أراض محل نزاع قضائي، ليبلغ عدد الكنائس والمباني التي تم توفيق أوضاعها منذ بدء عمل اللجنة حوالي 508 كنائس ومبان تابعة. كما قررت اللجنة تقنين أوضاع 80 كنيسة ومبني تابعاً في ديسمبر عام 2018 منها 9 كنائس ومبان تم تقنين أوضاعها بشرط قيامها باستيفاء متطلبات السلامة الإنشائية، واستيداء حق الدولة بالنسبة لتلك المقامة علي أراض ملك الدولة، إضافة إلي 39 كنيسة ومبني تابعًا تم تقنين أوضاعها بشرط استيفاء اشتراطات السلامة الإنشائية واستيداء حق الدولة. اما القرار السادس للجنة فكان في مارس عام 2019 بتقنين أوضاع 93 كنيسة و72 مبني خدمات تابعة للطوائف الأرثوذكسية والإنجيلية. واعتمد مجلس الوزراء في 7 ابريل قرار اللجنة السابع بتقنين أوضاع 111 كنيسة ومبني تابعا، ليكون إجمالي الكنائس والمباني التي تم تقنين أوضاعها 864 كنيسة ومبني حتي الآن. وكشف المجلس عن التوزيع الجغرافي للكنائس والمباني التي تم توفيق أوضاعها بواسطة لجنة تقنين أوضاع الكنائس برئاسة رئيس مجلس الوزراء والتي تغطي القطاعات الجغرافية بأنحاء الجمهورية، وجاء توزيعها علي النحو التالي: محافظة المنيا 127 كنيسة ومبني ومحافظة الجيزة 109 ومحافظة القليوبية 81 ومحافظة الإسكندرية 77 ومحافظة سوهاج 66 ومحافظة البحيرة 66 ومحافظة الشرقية 61ومحافظة أسيوط 54 ومحافظة القاهرة 39 ومحافظة الغربية 29 ومحافظة أسوان 26 ومحافظة الدقهلية 26 ومحافظة الأقصر 22 ومحافظة بني سويف 18 ومحافظة قنا 12 ومحافظة البحر الأحمر 11ومحافظة السويس 10 ومحافظة المنوفية 8 ومحافظة مطروح 7 ومحافظة الإسماعيلية 6 ومحافظة كفر الشيخ 5 ومحافظة الفيوم 2 وأخيراً محافظة الوادي الجديد 2 كنيسة ومبني. وأكدت الحكومة أن الوصول لهذا العدد من تقنين أوضاع الكنائس يعكس المجهود الذي بذلته اللجنة في هذا الملف ومازال العمل في هذا الملف، مشيرا إلي أن هناك مباني لا يمكن إعطاء التصريحات لها والتي تكون مبنية علي أراض أثرية أو المباني علي تلك الشاكلة ويتم البحث عن موقع بديل ويتم عقد اجتماع كل شهرين مع اللجنة لتسريع وتيرة الانتهاء من هذا الملف بشكل كامل، كما أن بناء الكنائس في مصر يؤسس للتعايش والمواطنة، وهو ما ظهر في بناء المسجد بجوار الكاتدرائية في العاصمة الإدارية الجديدة. ولايقل أهمية عن تقنين اوضاع الكنائس ملف بناء الكنائس الجديدة وترميم الكنائس القديمة، وكما نجحت الدولة في تذليل العوائق امام ذلك الملف ايضا، فخلال الفترة من عام 2014 حتي 2019 تم افتتاح كاتدرائية ميلاد المسيح بالعاصمة الإدارية الجديدة، وتنفيذ 6 كنائس بمدينة حدائق أكتوبر، فضلاً عن 7 كنائس جار تنفيذها بكل من مدن المنصورة الجديدة والعلمين الجديدة وغرب قنا والعبور الجديدة وشرق بورسعيد وأكتوبر الجديدة وغرب أسيوط، وايضا تمت الموافقة علي اعمال احلال وتجديد 66 كنيسة وملحقاتها للطوائف الثلاث: الأرثوذكسية والإنجيلية والكاثوليكية في المنيا خلال الفترة من سبتمبر 2016 الي ديسمبر 2018 ما بين مبان للخدمات وسكن للرعاة. وفي عام 2014 تم صدور قرارات تخصيص لبناء 7 كنائس في 5 مدن هي: العبور والفيوم الجديدة وطيبة الجديدة وسوهاج الجديدة والقاهرة الجديدة، وفي عام 2015 تم صدور قرارات تخصيص لبناء 5 كنائس في 5 مدن هي: طيبة الجديدة والعاشر من رمضان والشروق والعبور و6 أكتوبر، وفي عام 2016 تم صدور قرارات تخصيص لبناء 9 كنائس في 8 مدن هي: الصالحية الجديدة و6 أكتوبر والفيوم الجديدة وأسوان الجديدة وأسيوط الجديدة و15مايو والمنيا الجديدة وبدر، وفي عام 2018 تم صدور قرارات تخصيص لبناء 10 كنائس في 6 مدن هي: سوهاج الجديدة وقنا الجديدة والسادات والعاشر من رمضان وناصر والعاصمة الإدارية الجديدة،وفي عام 2019 تم صدور قرارات تخصيص لبناء 4 كنائس في 3 مدن هي: المنصورة الجديدة وحدائق أكتوبر وبني سويف الجديدة. وقبل ايام نشر المركز الاعلامي لمجلس الوزراء »انفوجراف» وضح نتائج أعمال اللجنة الرئيسية لتقنين أوضاع الكنائس أسفرت عن توفيق أوضاع 512 كنيسة و352 مبني بالإضافة الي 30 كنيسة ومبني تم تقنين أوضاعها بشرط استيفاء اشتراطات السلامة الانشائية ليصل اجمالي ما تم توفيق أوضاعه حتي الآن إلي 894 كنيسة ومبني علي مستوي الجمهورية.