بدأ طارق ضياء الدين رئيس نيابة الأموال العامة بإشراف المستشار على الهوارى المحامى العام الأول للنيابة التحقيق فى تقرير الجهاز المركزى للمحاسبات حول مخالفات بطولة أمم أفريقيا 2006 والتى قامت بتنظيمها مصر وفازت بها. وجاء بتقرير الجهاز المركزى للمحاسبات وجود مخالفات حول أعمال اللجنة العليا للبطولة واللجنة المنظمة وعدد من اللجان المعاونة، كما كشف عن وجود مخالفات شابت عملية بيع تذاكر المباريات حول بيع تذاكر المباريات إلى بعض الأشخاص وبيعها بالسوق السوداء. كما جاء بالتقرير وجود ملاحظات خاصة على طرق استقبال الفرق المشاركة فى البطولة والضيافة وإقامة الفرق . كان النائب العام المستشار الدكتور عبد المجيد محمود قد أحال تقرير الجهاز المركزى للمحاسبات إلى نيابة الأموال العامة للتحقيق فى المخالفات الوارد بالتقرير وأرسل خطابا رسميا إلى وزارة الرياضة يفيد بإحالة ملف بطولة أمم أفريقيا 2006 إلى نيابة الأموال العامة العليا، للتحقيق فى كافة المخالفات التى وردت فى تقرير الجهاز المركزى للمحاسبات. جاء خطاب النائب العام ردا على وزارة الرياضة التى سبق وأرسلت ملف أمم أفريقيا 2006 إلى النائب العام، بناءً على طلب الأخير، للتحقيق فى المخالفات التى تضمنها تقرير الجهاز المركزى للمحاسبات بشأن أمم أفريقيا 2006 .