قرر مجلس جامعة النيل برئاسة الدكتور طارق خليل رئيس الجامعة، تمسكه باستمرار عمل الجامعة كجامعة بحثية أهلية لا تهدف إلى الربح وناشدوا كل الجهات المعنية فى مصر سواء فى الحكومة أو مؤسسات المجتمع المدنى بدعم هذا الاتجاه وإصدار القرارات المناسبة التى تؤكد على ذلك، وذلك بعد تخصيص الأراضى والمبانى المخصصة لها فى مدينة الشيخ زايد، وكذلك المعامل التى تم إنشاؤها لمشروع لمدينة زويل للعلوم والتكنولوجيا. من جهة أخرى، رفع أولياء أمور الطلاب بالجامعة مذكرة عاجلة لكل من المجلس الأعلى للقوات المسلحة ومجلس الوزراء أكدوا فيها أنهم وأبناؤهم متمسكون ببقائهم فى جامعة النيل ولن يتركونها نظرا لتميزها، وقالوا: نحن كأولياء أمور نرحب بكل قرار صادر عن مجلس الوزراء يراعى مصلحة جامعة النيل وأبناءنا حتى مع وضعها ضمن المشروع القومى لنهضة التعليم والبحث العلمى الذى تتبناه الحكومة حاليا. وأكد أولياء الأمور، أن الطلاب سواء فى مرحلة البكالوريوس أو الدراسات العليا بدأوا يشعرون بالقلق من توقف الدراسة بها. وكشف الدكتور عمرو عبد العزيز الأستاذ بكلية طب أسنان جامعة عين شمس وعضو مجلس الآباء بالجامعة، أن أولياء الأمور أوضحوا فى مذكرتهم للمجلس الأعلى للقوات المسلحة وإلى مجلس الوزراء أنهم يرون أنه لا داعى لتعطيل الطلاب عن الانتفاع بمقر الجامعة فى مدينة الشيخ زايد لحين الوصول إلى التصور النهائى لهذا المشروع ونحن والجامعة نتعهد قانونا بالموافقة على ما ترونه مستقبلا بشأن وضع جامعة النيل ضمن هذا المشروع القومى أو غيره من المشروعات الأخرى.