قال عبد الرحمن الجوهرى – المتحدث الرسمى باسم حركة كفاية – إن فرج فوده يمثل حالة من حالات رفض التيار الدينى الجهادى الذى نمى بشكل كبير فى صعيد مصر فى فترة الثمانينات، حيث كان فرج فوده أفضل من تحدث عنهم، فكان كاشفا لتلك الحركات بالعودة إلى أصل تكونها وهى جماعة الإخوان المسلمين، فالجهاديين اعتنقوا فكر حسن البنا الذى تبناه سيد قطب، حيث استحلال فكرة القتل. جاء ذلك خلال الندوة التى نظمها المعهد المصرى الديمقراطى بالإسكندرية، بعنوان: "فرج فوده شهيد الفكر"، فى ذكرى الكاتب الراحل فرج فوده، بمقر المعهد بالإسكندرية. و أشار إلى أنه فى ذكرى وفاة فرج فودة نتذكر سيرة كاتب ومفكر خاص جدا فى وقت كان يصعب على الكثيرين مواجهه الفكر الدينى الذى تغول على الحياة فى مصر فى الثمانينات، وأن الرئيس محمد مرسى هو من قام بالإفراج عمن قتلة، ضمن المفرج عنهم فى عام 2012. وأوضح أن فرج فودة واجه التيار الدينى بكل روافده، وأن المناظرة الشهيرة بينه وبين نائب المرشد العام مأمون الهضيبى، كانت السبب الرئيسى فى صدور فتوى قتل واغتيال فرج فودة والتى ربط بين العمليات الإرهابية واستقلال بعض الإمارات الإسلامية فى عهد السادات وبين تغول التيار الدينى النابع من جماعة الإخوان المسلمين، ومحاولة تمكين الفكر الدينى على المجتمع لمحو ثقافة المجتمع المصرى. مستنكرا فكر الفريضة الغائبة "الجهاد" التى اعتبرها الإسلاميون فريضة وبدأوا فى تطويعها لانتهازيتهم السياسية، وقاموا بتطويع النصوص القرآنية لذلك، والتى قام فودة بالرد عليها من خلال كتابة "الحقيقة الغائبة". وأشار إلى جبهة علماء الأزهر برئاسة الشيخ عبد الغفار عزيز، بيان حكموا فيها بالردة على فرج فوده لمطالبته بفصل الدين عن الدولة، بما اعتبره "الجوهرى" سقطة من الأزهر وكان رد الأزهر غير كاف ومتعال. واستنكر "الجوهرى" أمية من قام بقتل فرج فودة، وأنه ارتكب جريمته بناء على فتوى ضللت رجل بسيط، ودفعته إلى قتل عالم ومفكر. وقال: "إن فرج فودة ككاتب كاشف كان يجهر برأية وجرئ فى مواجهه التغول الدينى، أمام فترة شهدت التكفير الذى وصل إلى حد القتل".
