قالت الهيئة العامة للخدمات البيطرية إن الهدف من البرنامج القومى للترقيم والتسجيل للحيوانات، يهدف في المقام الأول إلى الترقيم الصحى والإنتاجى للثروة الحيوانية وذلك لترشيد وتوجيه الدعم المقدم للثروة الحيوانية من الدولة، وأن البرنامج يساهم في السيطرة على الأمراض الوبائية في حالة حدوثها. وأضافت الهيئة في بيان لها، أن من أهداف البرنامج أيضا العمل على التحسين الوراثي للحيوانات المنتجة للحوم والألبان من خلال التلقيح الصناعى، وتوفير قاعدة بيانات متكاملة تساهم في المشروعات القومية الكبرى التي تخص الثروة الحيوانية، سهولة متابعة الموقف الوبائي لبعض الأمراض بمختلف المحافظات كل على حدى، والتقصى الوبائى ومتابعة حركة الحيوانات بين المحافظات ومن وإلى الدولة. وأشارت إلى مساهمة البرنامج في متابعة الحالة الصحة للحيوانات المريضة التي يتم علاجها بالوحدات البيطرية التابعة للهيئة، الحفاظ على الملكية الخاصة لبعض الحيوانات لأصحابها كما يحدث في الخيول العربية الأصيلة والحيوانات الأليفة ( قطط – كلاب).