أمر المستشار علي عمران، النائب العام المساعد القائم بأعمال النائب العام، بإحالة 198 من لجان العمليات النوعية بجماعة الإخوان، بمحافظتي الجيزةوالغربية، إلى القضاء العسكري، تنفيذًا لأحكام القانون الخاص بشأن تأمين وحماية المنشآت العامة والحيوية. وتضمنت القضية ضبط 90 متهمًا من الجناة، اعترف 35 متهمًا منهم بانضمامهم والآخرين، للجان جماعة الإخوان النوعية، وحيازتهم وإحرازهم لأسلحة نارية ومتفجرات، واعترفوا بتفاصيل ارتكابهم لعدد 64 عملية إرهابية، من بينها وضع عدد من العبوات الناسفة أعلى قضبان السكك الحديدية وتفجيرها لتعطيل حركة القطارات. وكشفت تحقيقات نيابة أمن الدولة العليا، في القضية بإشراف المستشار الدكتور تامر فرجاني، المحامي العام الأول للنيابة، عن اتفاق قيادات جماعة الإخوان، على تأسيس لجان عمليات نوعية تضم مسلحين من عناصرها بكافة محافظات الجمهورية، لتكون جناحًا عسكريًا لها بديلا عن النظام الخاص، وأن القيادي الإخواني عبد الفتاح محمد إبراهيم، كان يتولى مسؤولية الإشراف على تلك اللجان. واستمعت النيابة، إلى عدد كبير من الشهود الذين كشفوا عن جرائم العناصر المسلحة لتلك اللجان وأغراضها الإجرامية، من استهداف للقضاة وأفراد وضباط القوات المسلحة والشرطة وإرهابهم بغية إثارة الفوضى في البلاد، فضلًا عن استهداف مؤسسات الدولة المصرية وسلطاتها العامة ومقوماتها بغرض إسقاطها، وشروعهم في قتل العديد من أفراد الشرطة وتخريب عدد من أقسامها ونقاطها والسيارات المملوكة لتلك الهيئة وضباطها، ووضع النار عمدا في أبراج الكهرباء ومنشآت الاتصالات. كما تضمنت الجرائم الإرهابية التي وردت باعترافات 35 متهمًا ألقي القبض عليهم، وضع عبوات ناسفة أعلى قضبان السكك الحديدية وتفجيرها بقصد تعطيل حركة القطارات، علاوة على وضع النار في أحد المحالج الخاصة بتخزين القطن، وتفجير عدد من محولات الكهرباء بمختلف مدن محافظتي الجيزةوالغربية والقرى بهما، وزرع عبوات ناسفة بالميادين والأحياء السكنية الحيوية وبمحيط محكمة كفر الزيات، ونقطة شرطة مرور الطالبية، وساحة مسجد العارف بالله أحمد البدوي (السيد البدوي) ومخازن تابعة لحي الأهرام، وأمام مبان محافظة الغربية، والجامعة العمالية، وقسم أول طنطا، ونقطة مرور العلو، ومبنى فرع البحث الجنائي بالمحلة الكبرى، ونادي ضباط الشرطة بطنطا، ووحدة مطافىء طنطا، ومكتب بريد أول كفر الزيات، وسنترال بسيون العام، وتفجير عدد من أبراج تقوية شبكات الهواتف المحمولة، ووضع النار في العديد من السيارات الحكومية. وتمكنت قوات الشرطة من ضبط المتهمين وبحوزتهم أسلحة نارية وذخائر وعبوات ناسفة وكميات من المتفجرات والقنابل، كما قامت أجهزة الأمن بمداهمة أحد الأوكار التي يختبىء بها المتهمون بمدينة السادس من أكتوبر في الجيزة، ومنهم مسؤول اللجان النوعية عبد الفتاح محمد إبراهيم، والذي لقي مصرعه و8 من قيادات الجماعة بعد مبادرتهم بإطلاق النيران على القوات المكلفة بضبطهم.