أثار وجود صحيفة «الحرية والعدالة» على متن طائرات مصر للطيران سخطا كبيرا بين بعض الركاب وأيضا العاملين بالشركة الوطنية مما دفع القيادة الجديدة للشركة والتى تولت المسئولية منذ أيام لوقف صعود الجريدة إلى الطائرات رغم سريان العقد المبرم بتوزيع الصحيفة الصادرة عن الحزب التابع لجماعة الإخوان على جميع طائرات مصر للطيران. ورغم تأكيد المسئولين فى وزارة الطيران المدنى على منع الصحيفة من الصعود على الطائرات إلا أن «أكتوبر» حصلت على صورة توضح استلام الشركة الوطنية لعدد الصحيفة الصادر يوم 19 أغسطس الجارى مما يثير الشكوك حول حظرها على الطائرات فيما أكدت مصادر أن الشركة تقوم باستلام الجريدة ولكن لا تقوم بتسليمها لأطقم الضيافة على الطائرات فيما ووجه الموظفون باتهمات مباشرة للقيادات الإخوانية المتواجدة بقطاع الطيران المدنى. والجدير بالذكر أن وزارة الطيران المدنى أعفت مجدى عبد الهادى الرئيس السابق للشركة القابضة للمطارات والقيادى الأخوانى من منصبه وعين مستشارًا للوزير كما تم الاطاحة برئيس الشركة القابضة لمصر للطيران توفيق العاصى والذى تم احتسابه على فصيل الإخوان هذا بالإضافة لاستبعاد كافة أفراد أمن مصر للطيران المنتمين لجماعة الإخوان ومنعهم من تأمين رحلات الطائرات المصرية.