نفي الدكتور محمد عبد البر، القيادي بجماعة الإخوان المسلمين و رئيس المكتب الإداري للجماعة بالقاهرة، وجود أي دور لأعضاء الجماعة وراء الاستقالات الجماعية التي تقدم بها أعضاء حزب المصريين الأحرار في الآونة الأخيرة، قائلا: " الإخوان أكبر من كده ". وقال عبد البر لا يوجد صراع مباشر بين الجماعة وحزب المصريين الأحرار، وأننا غير مستفيدين بأي صورة من هذا الحدث، مؤكدا أن الصراعات السياسية في الانتخابات البرلمانية أمرا متعارف عليه بين جميع التيارات السياسية.
ومن جانبه قال محمود عمار، عضو الهيئة العليا لحزب الحرية والعدالة، الجناح السياسي لجماعة الإخوان المسلمين "إن هذه الاتهامات باطلة وليس لها أي أساس من الحقيقة"، وطالب حزب المصريين الأحرار بالكشف عما لديهم من ملفات أو مستندات تؤكد هذا الأمر.
وكان مصدر مطلع بحزب المصريين الأحرار قد صرح بأن الحزب لديه مستندات تؤكد قيام "جماعة الإخوان المسلمين" و"حزب الحرية والعدالة" بتحريض أعضائه علي تقديم استقالاتهم في محافظات السويس و بورسعيد.