نشبت أزمة حادة بين المستشار محمد ناجي شحاتة رئيس هيئة محكمة جنايات القاهرة التي تنظر القضية المعروفة إعلامياً ب«أحداث مجلس الوزراء»، وعضو هيئة الدفاع عن المتهمين المحامي والمرشح الرئاسي السابق خالد علي قبل رفع الجلسة للمداولة وإتخاذ القرار. بدأت الأزمة بعد السؤال الإستنكاري الذي وجهه القاضي لعضو هيئة الدفاع والذي كان «هو مطلوب من الجيش والشرطة تضرب وتسكت..»، فصاح خالد علي معترضاً على حديث القاضي قائلاً: «حضرتك واخد موقف من المتهمين قبل الحكم»، طالباً من سكرتير المحكمة اثبات كلام الدفاع في محضر الجلسة لترفع المحكمة اثناء ذلك الجلسة للمداولة و إتخاذ القرار. وكانت النيابة العامة قد اتهمت دومة و268 آخرين بأثارة الشغب والتعدي على قوات الأمن والأعتداء على الممتلكات العامة وحرق المجمع العلمي في «أحداث مجلس الوزراء» التي وقعت في ديسمبر 2011.