عين المهندس ابراهيم محلب، رئيس مجلس الوزراء، الدكتور علاء عبدالغفار، الطبيب البيطري نائبًا لرئيس الهيئة لشؤون التعليم قبل الجامعي، وذلك بناء على توصية من الدكتور محمود أبوالنصر، وزير التربية والتعليم. كان مجلس إدارة الهيئة اتخذ الإجراءات القانونية لوقف قرار رئيس الوزراء، بإعادة تشكيل مجلس إدارة الهيئة القومية لضمان جودة التعليم والاعتماد مع ما يترتب على ذلك من آثار وفقًا لنص المادة 312 من قانون المرافعات، لحين الفصل في الدعوى 57000 لسنة 68 قضائية، حيث أقام أسامة ذكري، المحامي الدعوى رقم 1243 لسنة 2014 أمام دائرة إشكالات تنفيذ محكمة شمال القاهرة بصفته وكيلًا عن مجلس إدارة الهيئة، ضد كل من رئيس مجلس الوزراء ووزيري التعليم والتعليم العالي. واتهمت الدعوى المذكورين بمخالفة نصوص الدستور الصادر في يناير 2014 و خاصة المواد 215 و216 والتي تنص على أن يعين رئيس الجمهورية رؤساء الهيئات المستقلة لمدة 4 سنوات قابلة للتجديد لمرة واحدة ولا يعفى من منصبه إلا في الحالات المحددة قانونًا والمعروف قانونًا أنه لايجوز التفويض في الاختصاصات الدستورية المخولة لرئيس الجمهورية وخاصة تعيين رؤساء الهيئات المستقلة.