قالت جماعة قاعدة الجهاد "تنظيم القاعدة" إنه لا علاقة لها بجماعة "الدولة الإسلامية في العراق والشام" التي تقاتل في سوريا، وتنأى بنفسها عن الاقتتال الداخلي لقوات المعارضة السورية. وقال التنظيم، في بيان على الإنترنت: "تعلن جماعة قاعدة الجهاد أنها لا صلة لها بجماعة الدولة الإسلامية في العراق والشام، فلم تخطر بإنشائها ولم تستأمر فيها ولم تستشر ولم ترضها، بل أمرت بوقف العمل بها، ولذا فهي ليست فرعا من القاعدة، ولا تربطها بها علاقة تنظيمية وليست الجماعة مسؤولة عن تصرفاتها". ويقود أبوبكر البغدادي "الدولة الإسلامية في العراق والشام"، بعد أن عصى أوامر أصدرها زعيم تنظيم "القاعدة" أيمن الظواهري، بالعمل بشكل مستقل عن فرع تنظيم القاعدة المنافس في سوريا "جبهة النصرة"، بقيادة أبو محمد الجولاني. ورفض البغدادي تنفيذ أوامر الظواهري وسعى لدمج الجماعتين، وفشل في ذلك. ولا يمكن التحقق من صحة البيان بشكل مستقل، لكنه نشر على مواقع إلكترونية عادة من تستخدمها "القاعدة".