تحتوي القهوة على نسبة عالية من الكافيين، تفوق بكثير تلك التي تحتوي عليها المشروبات الغازية، لذلك فإن تناول كوب من القهوة يزود الجسم بكمية كبيرة من هذه المادة، وينصح الأطباء بعدم الإكثار من القهوة حفاظاً على صحة الجهاز العصبي. ويُمتص الكافيين من الجسم بسرعة كبيرة، ويمكن أن تحرم هذه المادة الإنسان من النوم أثناء الليل من خلال تنبيه الجهاز العصبي. يمكن أن تسبب زيادة كمية الكافيين المستهلكة بشكل يومي فقدان كميات كبيرة من الكالسيوم والمغنيسيوم، ويؤدي ذلك إلى الإصابة بترقق وهشاشة العظام، لذلك ينصح أن لا تزيد كمية القهوة يومياً عن 300 ميلي عند الأشخاص المعرضين للإصابة بهذا المرض. أشارت بعض الدراسات إلى أن زيادة كمية مادة الكافيين عند النساء الحوامل، يمكن أن تزيد خطر الإجهاض لديهن، ورغم أن هذه الدراسات لم تثبت ارتباط الكافيين مع تشوهات الجنين والولادة المبكرة، إلا أن من المستحسن التخفيف من هذه المادة أثناء الحمل للحصول على قدر كافي من النوم والراحة.