أقام خالد علي المرشح السابق لرئاسة الجمهورية ، دعوى قضائية أمام محكمة القضاء الإدارى بمجلس الدولة ، ضد كل من الدكتور محمد مرسي رئيس الجمهورية والمشير حسين طنطاوى رئيس المجلس الأعلي للقوات المسلحة ، يطالبهم فيها بوقف تنفيذ وإلغاء القرار الصادر بإلغاء مجلس الدفاع الوطني . وأستندت الدعوى رقم 49469 لسنة 66 قضائية، الي أن المجلس العسكرى قام بانتهاك واضح وصريح للنظام الديمقراطى التى تسير عليه البلاد لإصداره لقرار تشكيل مجلس الدفاع الوطنى وسيادة الطابع العسكرى والهيمنة العسكرية على أغلبية أعضائه.