رغم أن منطقة قايتباي تعد واحدة من أهم الأروقة الأثرية الأكثر إبداعا في مصر، إلا أنها تفتقد الأمن والحماية، ففي بداية دخولك المكان تقع عيناك على واحد من قلاع مصر الإسلامية مسجد ابن برقوق هو مقصد لكل دارسي الحضارة الإسلامية في العصر الحديث، تصميمه الداخلي نموذج يحتذى بها من قبل طلاب الكليات الفنية. على بعد خطوات من جامع ابن برقوق، يوجد مسجد الأشراف الذي يليه مسجد قايتباي، وهو واحد من علامات مصر الأثرية، ولذلك طبع على الجنيه المصري، ليصبح واجهة مصرية يعرفها العالم أجمع. ورغم أهمية هذه المنطقة وما تضمه من آثار إسلامية يشهد العالم بتصميمها البارع، إلا أنها معرضة للسرقة والإهمال في غياب رقيب، أو أمن يحمي المكان، حيث توجد لافتة على مكان خال مهجور تحمل عنوان "قسم قايتباي".