أظهرت نتائج الفرز الأولية تفوق مرشح حزب الحرية والعدالة الدكتور محمد مرسى علي الفريق أحمد شفيق في معظم محافظات الصعيد. وتفوق شفيق في معظم محافظات الوجه البحري، ففي محافظة سوهاج حصل مرسى على 71 ألف صوت، بينما حصل شفيق على 39 ألف صوت، وفي بنى سويف حصل مرسى على 305 آلاف صوت.