كشف تقرير صادر عن الجهاز المركزي للمحاسبات عام 2014/2015، صرف مكافآت لمدير مستشفى عين شمس التخصصي والنواب بالمخالفة لقرار تعيينهم، وبالمخالفة للمادة 9 من لائحة المستشفى المعتمدة من مجلس الجامعة في 26 سبتمبر 2012، وتنص على «ينتدب مدير المستشفى بقرار من رئيس الجامعة بناء على ترشيح مجلس الإدارة لمدة ثلاثة أعوام قابلة». وصدر قرار رئيس الجامعة رقم 20 في 19 يناير 2012 بتعيين الدكتور محمد حلمي محمد الغر، أستاذ الجراحة العامة بكلية الطب جامعة عين شمس مديرا لمستشفى عين شمس التخصصي، اعتبارا من 10 يناير 2012 وحتى 9 يناير 2015 لمدة ثلاث سنوات. وأوضح التقرير الذي حصلت «البديل» على نسخة منه، أنه تم تجديد تعيين مدير المستشفى بقرار رئيس الجامعة رقم 17 في 16 يناير 2015، اعتبارا من 10 يناير 2015، وحتى 29 يونيو 2017 تاريخ بلوغ السن القانوني، كما صدر قرار رئيس الجامعة رقم 80 في 30 يناير 2012 بصرف مكافآة شهرية قدرها ثلاثين ألف جنيه من الموارد الخاصة للمستشفى. وأضاف التقرير أنه تبين لدى الفحص بالمستشفى، قيامها بصرف مكافآت لمدير المستشفى شهريا بخلاف مبلغ الثلاثين ألف جنيه المحددة بقرار رئيس الجامعة، حيث تم صرف قيمة 450% شهريا من المرتب الأساسي للمذكور، بمبلغ 4 آلاف و842 جنيها، بجانب صرف مبلغ ألف و750 جنيها، تحت مسمى الإشراف على لجان الممارسات والمناقصات التي تتم بالمستشفى بالمستند رقم 7216 في 29 مارس 2015. ولفت التقرير أيضا إلى صرف حوافز شهرية لشاغلي وظيفة زميل استشاري مساعد – استشاري- متفرغ بنسبة 470% من المرتب الأساسي، التي تصرف لجميع العاملين بالكارد العام للمستشفى، بخلاف ما يصرف لهم من المكافآت المقررة لأعضاء هيئة التدريس بالجامعة، والجمع بينها وبين بدل الجامعة المقرر، وذلك بالمخالفة للائحة المستشفى. وطالب الجهاز المركزي للمحاسبات بضرورة تصويب الوضع بالنسبة للحالة المعروضة، وحصر جميع الحالات المماثلة من نواب رئيس الجامعة، وإفادة الجهاز.