قضت المحكمة العسكرية المركزية ببراءة جميع متهمى أحداث 28 و29 يونيو بالتحرير ذلك فى الجنايات أرقام 699،700،701، 704 لسنة 2011 ج شرق عسكرية. وكانت النيابة العسكرية قد وجهت للمتهمين اتهامات باستعمال القوة والعنف، وتهديد موظفين عموميين مكلفين بخدمة عمومية، وهم ضباط وأفراد وزارة الداخلية المعنيون بتأمين مبنى الوزارة، مرددين بعض الهتافات العدائية، وهاجموا القوة ولم يبلغوا مقصدهم. والمتهمون الذين صدرت لهم أحكام البراءة 699 جنايات شرق القاهرة هم: "أحمد زكى محمد عبد العال، باسم رضا راغب السيد، محمود عبد العزيز عامر عبد العزيز، حسين محمد أحمد رمضان، محمد عبد الحميد محمد عبد الحميد، وعلى أحمد ثابت". فيما تم الإفراج عن المتهمين فى القضية رقم 700 جنايات شرق القاهرة، وهم: "محمد محمود عطا بكري، محمد رجب عبد العاطى عبد اللطيف، حسام الدين محمد عبد المنعم، هشام أحمد محمد حبيب، مصطفى محمد هاشم سعيد، محمد محمد نجيب حلمى، أحمد محمد محمد محمد أحمد، هشام عبد الله عطية، يحيى زكريا حسين ومصطفى السيد محمد أحمد ومحمد سليمان خلف مرسى. كما تم الإفراج عن المتهمين فى القضية رقم 701 جنايات شرق القاهرة، وهم: "لؤى مصطفى محمد نجاتى ومحمد عبد المنعم حنفى ومصطفى طارق محمد صالح وأحمد عبد المقصود إبراهيم"، فضلاً عن الإفراج عن المتهمين فى القضية رقم 704 جنايات شرق القاهرة، وهم: "إبراهيم محمود أحمد ومصطفى حمادة عبد الواحد وحسين مراد محمود ومحمد عادل فتحى إبراهيم وصبرى محمود محمد حسن ونادر عصام على عبد ربه، وأحمد محمد مولد جابر الفقى".