تم إنشاء هذه الكنيسة في عهد الملك عبد الله الثاني ابن الحسين المعظم وفي عهد صاحب الغبطة بطريرك المدينة المقدسة كيريوس كيريوس ثيوفلس الثالث ومتروبوليت فيلادلفيا وسائر الأردن صاحب السيادة المتروبوليت فينيذكتوس وعلى نفقة المتبرع المهندس برفيريوس جهشان في السنة الخلاصية 2006. أما عن فترة تأسيسها فقد شرع المتروبوليت فينيذكتوس منذ تولي مهامه كراعٍ للكنيسة الأرثوذكسية وأبنائها في الأردن، بالعمل على ترتيب البيت الداخلي قبل البدء بتنفيذ المشاريع الخدماتية والرعوية، لإيمانه بأن بناء الجسد بحاجة إلى بناء الروح بناءً صلبًا متينًا، كما اهتم سيادته بالصلوات والخدم الإلهية، ثم بالكنائس التي تقام بها هذه الصلوات فحول إحدى غرف المطرانية في جناح غرف الضيافة إلى كنيسة أسماها كنيسة القديس ألكسيوس رجل الله لإقامة الخدم الإلهية والصلوات اليومية. ومع الوقت كان لا بد من تغيير موقع هذه الكنيسة فتواجد المصلين والضيوف في نفس المكان أصبح غير لائق، فاقترح المطران تيموثاوس خلال إحدى زياراته للمطرانية على المتروبوليت فينيذكتوس استغلال المساحة الخلفية للمطرانية (ساحة نافورة المياه)، لبناء كنيسة جديدة لنفس الغرض، مقدمًا شرحًا لشكل البناء، فأعجب سيادته بالفكرة، وتحمل عبء بنائها على مسؤوليته، وكنا قد سمعنا بنبوءة الأب المتنيح الشيخ إسحاق الآثوسي بإقامة كنيسة في المطرانية تصبح كدير تقام فيه الصلوات باستمرار. تم الاتصال بالمهندس برفيريوس جهشان عله يساعدنا في رسم مخطط أو شكل أولي للكنيسة فلم يتوان وقدم لنا الرسم المطلوب، وجاء هذا الإنسان بالعناية الإلهية بعد فترة طالبًا موعدًا لمقابلة صاحب السيادة معلنًا رغبته ببناء هذه الكنيسة وكل ما يلزمها، فدهشنا لأنه لم يسبق ذكر أي شيء من هذا القبيل أمامه ولكننا كنا نؤمن بأن قديسنا القديس نكتاريوس( الإسم الذي كان حاضرًا في ذهننا لهذه الكنيسة) سيرتب كل شيء، ولأن المتبرع غير المنتظر اسمه برفيريوس اقترح صاحب السيادة على الفور اسم القديس برفيريوس، إلا أن المهندس برفيريوس وخضوعًا لإحساس داخلي رفض مصرًا أن تحمل الكنيسة اسم القديس نكتاريوس. وتعد الصويفية أحد احياء منطقة وادي السير غرب العاصمة الأردنية عمّان، تشتهر بأنها من أهم الأسواق التجارية بالعاصمة ذات الماركات العالمية، من أشهر أسواقها شارع الوكالات الخاص بالمشاة. وتعد الصويفية من ارقى مناطق السكن في عمانالغربية. من معالمها: البركة مول وفندق ومنتجع الافرست والمدارس الأمريكية الحديثة على طريق المطار والصويفية افينيو وغيرها.