ينظم المعهد المسكونيّ للشرق الأوسط الدورة السنوية الخامسة للتنشئة المسكونية، والتي تمتد على ثلاثة أسابيع بمشاركة طلاب من حركات الشباب في الكنائس، في مختلف البلاد العربية (لبنان وسوريا والعراق ومصر والسودان وفلسطين والأردن)، إضافة غلى مشاركين من كليات اللاهوت والجامعات. دورة "التنشئة المسكونية" تعتبر أساسية في برنامج المعهد، لمن يريد دورة أخرى عبر الإنترنت، تضمّ عددًا من الدروس المتخصّصة؛ كما يؤمن المعهد مرحلةً ثالثة للطلاب الذين يريدون إنجاز أبحاث في مواضيع مسكونية تتكامل مع دروس التنشئة. تمتد هذه الدورة السنوية الخامسة للتنشئة المسكونية، من 1 إلى 20 يوليو 2019، بمدينة "برمانا" اللبنانية، وتضم طلابا من كل الكنائس المسيحية. ويختبر المشاركون "المسكونية"، مع كافة المشاركين الآخرين، من خلال الصلاة معًا، والدراسة معًا، والحياة معًا، والفرح معًا، بالإضافة إلى برنامج زياراتٍ ولقاءاتٍ خارجية يعتبرها المعهد جزءًا من التنشئة المسكونية المرجوّة.