أصدر الرئيس عبد الفتاح السيسى قرارا جمهوريا بشأن تنظيم الأمانة العامة لمجلس الدفاع الوطني، وينص على تشكيل الأمانة العامة لمجلس الدفاع الوطنى برئاسة الأمين العام وعدد كاف من الأعضاء ويكون مقرها وزارة الدفاع. وأوضح السفير إيهاب بدوى المتحدث باِسم رئاسة الجمهورية أنه طبقاً للقرار تختص الأمانة العامة باعداد مشروع جدول أعمال اجتماعات مجلس الدفاع الوطنى وتحضير الموضوعات التى تطرح فى الجلسة٬ وتلقى تقارير الوزراء وقادة القوات المسلحة والمختصين بالدولة المطلوب عرضها على المجلس. وإعداد الدراسات والبحوث والوثائق والمستندات اللازمة لأعمال المجلس والقيام بإجراءات الدعوة لعقد جلسات المجلس العادية وغير العادية والقيام بأعمال السكرتارية لجلسات المجلس و إتخاذ الإجراءات اللازمة لتنفيذ قرارات المجلس ومتابعة تنفيذها وحفظ وثائق المجلس ومحاضر الجلسات وإتخاذ الإجراءات اللازمة لتأمينها. كما تختص باعداد تقرير نصف سنوى فى شهرى يناير ويوليو من كل عام، وآخر سنوى يتضمن بياناً بالموضوعات والمسائل التى نُظرت أمام المجلس، ويُعرض هذا التقرير على السيد رئيس المجلس و تنفيذ أية مهام أخرى توكل إليها. وقد نص القرار على أنه يصدر بتعيين الأمين العام للمجلس وتحديد معاملته المالية قرار من رئيس الجمهورية بناءً على ترشيح وزير الدفاع.