أكدت هيئة السكة الحديد أنها تنفذ عمليات التطوير والصيانة لعدد 941 كوبري ونفق علي امتداد الشبكة ، تشمل الكباري المعدنية والخرسانية والأنفاق وكباري المشاة ، بما يحقق أعلى معايير السلامة والأمان على الشبكة الحديدية. بعض مشروعات هيئة السكة الحديد
- إنشاء كوبري الفردان الجديد أعلى قناة السويس الجديدة وتطوير الكوبري القائم على القناة القديمة لربط سيناء بمدن القناة وباقي المحافظات - جاري إنشاء كوبرى مزدوج بالقناطر الخيرية ضمن خطة إزدواج خط قليوب - منوف - طنطا). - تعد كبارى ( إمبابة - بنها - كفر الزيات من أبرز الكباري المتحركة أعلى النيل، وتسمح بمرور السفن والمراكب بالتنسيق مع هيئة النقل النهرى.