بدأت وزارة الموارد المائية والرى فى تنفيذ برنامج لتطوير مؤسساتها وهياكلها التنظيمية المركزية والإقليمية فى ضوء مبادئ الإدارة المتكاملة للموارد المائية ورفع كفاءة ادارة الموارد المائية فى مصر، وذلك بالتعاون مع وزارة التنمية الإدارية. وقد أوضح الدكتور نصر الدين علام أن الوزارة بدأت فى برامجها للتطوير المؤسسى من خلال استراتيجية تستهدف تحقيق اللامركزية وزيادة مساهمة القطاع الخاص فى أدارة المشروعات المائية، وقال إن التطوير المؤسسى سوف يوفر المناخ المناسب لتطبيق آليات الإدارة المتكاملة ومشاركة المنتفعين فى منظومة الإدارة المائية ومشاركة القطاع الخاص لكى يقوم بالاستثمار فى مجال المياه مثل تشغيل وصيانة المنشآت المائية؛ مع التأكيد على عدم استحداث أى أعباء على صغار المنتفعين تحقيقاً لمبدأ العدالة والتكافل وطبقاً لإلتزام الدولة برعاية ودعم المزارعين ومراعاة البعد الاجتماعى. وأكد على ضرورة تعديل القوانين واللوائح المدعمة لتلك الاستراتيجية وتطوير نظم الإدارة عبر نقل السلطات والمسئوليات من المستوى المركزى إلى المستوى الإقليمى بالإسراع فى معدلات إنشاء الهندسات والإدارات العامة المتكاملة بما يحقق فاعلية وكفاءة ادارة الموارد المائية فى مصر.