استقبل سجن الوادى الجديد عدداً من القيادات الإسلامية البارزة بجماعة الإخوان المسلمين والجماعة الإسلامية من محافظة أسيوط، وذلك على خلفية أحداث العنف التى وقعت مؤخراً ونتج عنها قتل وحرق منشآت وتدمير للكنائس والمحلات التجارية والمبانى والأقسام الشرطية، حيث تم ترحيل 56 من قيادات الإخوان والجماعات الإسلامية المتورطين فى تلك الأحداث. وصرح مصدر أمنى بأن من بين من استقبلهم سجن الوادى الجديد من القيادات الإسلامية، والذين قررت النيابة حبسهم احتياطياً على ذمة التحقيقات، قد تم نقلهم تحسباً لوقوع أحداث عنف أو محاولة اقتحام لسجن أسيوط بقصد تهريبهم.